爱尔兰冠状病毒测序联盟

爱尔兰冠状病毒测序联盟由科学基金会爱尔兰资助，由Paul Potter教授从Teagasc Moorepark领导。该项目的目的是序列或“读取”SARS-COV-2的遗传信息，导致Covid-19的病毒。这将使我们能够跟踪病毒的传播以及其遗传序列的任何变化，这可能影响疾病或治疗。

概括

SARS-COV-2病毒包含可能随时间变化的遗传信息。如果我们能够跟踪这些更改，我们可以映射病毒在地区的传播方式。这可以支持努力应对感染簇，因为它们产生并最小化病毒的传播。收集爱尔兰病毒的序列也意味着我们可以提取重要的新变化，这可能影响病毒引起疾病或逃避治疗或疫苗的能力。

这种神动脉动画显示SARS-COV-2的谱系随时间的发生。按Play查看谱系的存在变化，以及Ireland的可能介绍路由。此绘图每天更新，因为新的基因组信息是上传到GISAID数据库。

研究项目会做什么？

科学基金会爱尔兰资助了由Teakgasc / APC Microbiome爱尔兰测序中心的国家联盟，在Moorepark，在Geathange Corn，Cork大学医院，大学学院都柏林国家病毒参考实验室，大学医院利默里克，博蒙特医院，三一学院都柏林，Nui Galway和Nui Maynooth。两家私营公司，真正的爱尔兰和Helixworks也在支持主动权。该联盟将序列与具有Covid-19的实验室确认的患者的患者样本中分离的病毒RNA序列，并使序列信息自由可用于分析。

该联盟将专门从患者样品中选择病毒序列，并通过使用来自牛津纳米孔的最新测序技术来检测那些微小的碎片。当它们通过仪器中的孔时，DNA片段的序列是“读取”作为电流的变化。使用特定的计算程序，如拼图，如拼图组装这些碎片，以生成病毒序列或基因组的完整图像。然后可以将该基因组与来自爱尔兰排序的样本进行比较，以追踪病毒的传播并调查突变率，因为它在全球范围内传播。